Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Znf428Q8C1M2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms