Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx17Q8BVL3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx17Q8BVL3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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