Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms