Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms