Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme1P97371 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme1P97371 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme1P97371 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme1P97371 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme1P97371 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme1P97371 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme1P97371 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms