Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcr4P70658 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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