Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbdsP70122 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms