Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Tmem63a-201ENSMUST00000027800 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms