Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms