Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms