Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Kdm5cP41230 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kdm5cP41230 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kdm5cP41230 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kdm5cP41230 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kdm5cP41230 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kdm5cP41230 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kdm5cP41230 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kdm5cP41230 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kdm5cP41230 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdm5cP41230 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kdm5cP41230 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kdm5cP41230 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
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Kdm5cP41230 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Kdm5cP41230 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Kdm5cP41230 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Kdm5cP41230 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdm5cP41230 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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