Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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