Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Slc1a6O35544 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Slc1a6O35544 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Slc1a6O35544 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Slc1a6O35544 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Slc1a6O35544 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Slc1a6O35544 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Slc1a6O35544 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc1a6O35544 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms