Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm8356J3QPD3 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms