Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm2035J3QP87 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm2035J3QP87 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm2035J3QP87 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm2035J3QP87 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm2035J3QP87 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm2035J3QP87 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms