Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms