Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scaf11E9PZM7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms