Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms