Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20521D3Z5F7 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20521D3Z5F7 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20521D3Z5F7 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20521D3Z5F7 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20521D3Z5F7 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20521D3Z5F7 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20521D3Z5F7 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20521D3Z5F7 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20521D3Z5F7 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20521D3Z5F7 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20521D3Z5F7 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20521D3Z5F7 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20521D3Z5F7 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20521D3Z5F7 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20521D3Z5F7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20521D3Z5F7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms