Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7 ms