Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms