Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms