Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod1Q9R0E2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms