Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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