Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM5

Yipf7, Protein YIPF7, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf7Q9JIM5 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Yipf7Q9JIM5 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Yipf7Q9JIM5 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Yipf7Q9JIM5 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Yipf7Q9JIM5 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Yipf7Q9JIM5 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Yipf7Q9JIM5 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Yipf7Q9JIM5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Yipf7Q9JIM5 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Yipf7Q9JIM5 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Yipf7Q9JIM5 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms