Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Parp10-201ENSMUST00000075689 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Ctnna3-201ENSMUST00000075099 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gtf3c6Q9D8P7 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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