Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms