Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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