Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ndufs4Q9CXZ1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms