Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms