Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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