Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3F2

Mmp21, Matrix metalloproteinase-21, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp21Q8K3F2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Mmp21Q8K3F2 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Mmp21Q8K3F2 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms