Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrit1Q8K099 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lrit1Q8K099 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lrit1Q8K099 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lrit1Q8K099 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lrit1Q8K099 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Lrit1Q8K099 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Lrit1Q8K099 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Lrit1Q8K099 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Lrit1Q8K099 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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