Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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