Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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FarsaQ8C0C7 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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FarsaQ8C0C7 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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FarsaQ8C0C7 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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FarsaQ8C0C7 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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FarsaQ8C0C7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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FarsaQ8C0C7 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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FarsaQ8C0C7 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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FarsaQ8C0C7 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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