Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NischQ80TM9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NischQ80TM9 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms