Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trak1Q6PD31 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms