Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Obox3Q3UT54 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms