Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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