Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hdgfl2Q3UMU9 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hdgfl2Q3UMU9 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hdgfl2Q3UMU9 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hdgfl2Q3UMU9 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hdgfl2Q3UMU9 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hdgfl2Q3UMU9 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hdgfl2Q3UMU9 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Hdgfl2Q3UMU9 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Hdgfl2Q3UMU9 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Hdgfl2Q3UMU9 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hdgfl2Q3UMU9 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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