Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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