Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ctdnep1Q3TP92 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ctdnep1Q3TP92 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ctdnep1Q3TP92 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ctdnep1Q3TP92 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ctdnep1Q3TP92 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ctdnep1Q3TP92 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ctdnep1Q3TP92 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ctdnep1Q3TP92 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ctdnep1Q3TP92 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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