Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 C2cd5-202ENSMUST00000111758 4062 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm20682-201ENSMUST00000176552 3517 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Eif2b3-201ENSMUST00000070610 1369 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Zmym1-201ENSMUST00000055013 3001 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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