Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
F13bQ07968 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms