Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SbdsP70122 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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