Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Usp46P62069 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Usp46P62069 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Usp46P62069 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Usp46P62069 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp46P62069 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp46P62069 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp46P62069 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp46P62069 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp46P62069 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp46P62069 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp46P62069 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp46P62069 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Usp46P62069 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp46P62069 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Usp46P62069 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms