Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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