Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Irf5P56477 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Irf5P56477 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Irf5P56477 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Irf5P56477 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Irf5P56477 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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