Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
RxraP28700 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms