Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pou3f1P21952 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms